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Bioinformatikerin / Bioinformatiker – Klinik für Infektiologie

  • Anstellungsart: Feste Anstellung
  • Arbeitsmodell: Vollzeit
  • Ausschreibungsnummer: 1979669

...sind Sie mittendrin

Die Position ist innerhalb der Klinik für Infektiologie der Medizinischen Klinik 2 zum nächstmöglichen Zeitpunkt zu besetzen.

Zur bioinformatischen Unterstützung für die Planung und Auswertung von interdisziplinären klinischen Studien, die den Einfluss des Mikrobioms und assoziierter Metaboliten auf die Entzündungsreaktion im Rahmen verschiedener Krankheiten zu untersuchen, suchen wir für unser Team eine engagierte Bioinformatikerin / einen engagierten Bioinformatiker. Unser Team besteht aus Forschenden der Bereiche Infektiologie, Rheumatologie und Gastroenterologie. Wir legen großen Wert auf eine offene und respektvolle Zusammenarbeit auf Augenhöhe in einem unterstützenden Umfeld.

 

Ihre Aufgaben:

  • Durchführung von Mikrobiomanalysen und Integration von zusätzlichen OMICS-Daten und klinischen Daten
  • Ergänzende metagenomische Analyse von Proben aus bestehenden Biobanken und Sammlungen
  • Durchführung von statistischen und bioinformatischen Analysen von komplexen Datensätzen im medizinischen Kontext
  • Entwicklung von neuen bioinformatischen Werkzeugen und Auswertungsstrategien
  • Nutzung vorhandener bioinformatischer Werkzeuge und Lösungen, u.a. zur Vorhersage der Nährstoffkonkurrenz zwischen Mikroorganismen und anderer Mechanismen der Kolonisationsresistenz
  • Entwicklung neuer Bewertungsanalysestrategien, Werkzeuge und Vorhersagemodelle
  • Validierung und Benchmarking dieser Instrumente und Modelle anhand verschiedener Datensätze
  • Unterstützung der Arbeitsgruppe
  • Unterstützung bei der Einwerbung von Drittmitteln und Vorbereitung von Förderanträgen für klinische Studien

... ist Ihr Profil gefragt

  • Erfolgreich abgeschlossenes Hochschulstudium (M. Sc.) der Bioinformatik, Biologie. Chemie oder eines vergleichbaren Bereichs
  • Abgeschlossene oder eingereichte Promotion zum Zeitpunkt des Eintritts, idealerweise mit einem thematischen Schwerpunkt in den Gesundheitswissenschaften
  • Erfahrung mit der Analyse von Sequenzdaten (z. B. mit Tools wie Qiime 2, MethaPhlAn, Kraken oder HUMAnN)
  • Verständnis für mikrobiologische und/oder molekularbiologische Grundlagen
  • Interesse am menschlichen Mikrobiom und an klinischer Forschung
  • Erfahrung im Projekt- und Datenmanagement ist von Vorteil
  • Solide Kenntnisse von Programmiersprachen wie Python, R und Bash; Erfahrung mit Hochleistungsrechnern (HPC) ist von Vorteil
  • Sicherer Umgang mit MS Office 
  • Flexibilität, Teamfähigkeit, Verantwortungsbewusstsein, Lernbereitschaft
  • Aufgrund gesetzlicher Bestimmungen ist ein gültiger Nachweis der Masernimmunität / Masernschutzimpfung notwendig

... wird Ihnen viel geboten

Werden Sie jetzt Teil unseres Teams

Kontakt: Prof. Dr. Maria Vehreschild
E-Mail: vehreschild@med.uni-frankfurt.de
Bewerbungsfrist: 19.06.2025
Geforderte Unterlagen: Anschreiben, Lebenslauf, Zeugnisse, Angabe von Gehaltsvorstellungen

 

Wir richten uns mit dieser Ausschreibung an Bewerbende jeden Geschlechts. Frauen sind in diesen Positionen am Universitätsklinikum Frankfurt unterrepräsentiert. Daher sind Bewerbungen von Frauen besonders willkommen. Schwerbehinderte Bewerbende werden bei gleicher persönlicher und fachlicher Eignung bevorzugt berücksichtigt.

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… sind Sie mittendrin in der Medizin von morgen

Genau hier sind Sie mittendrin in der Medizin von morgen. Die Universitätsmedizin Frankfurt gehört zu den führenden Universitätskliniken in Deutschland. Bei uns ziehen über 8.500 Menschen aus über 100 Nationen an einem Strang. Aus Wissen wird Gesundheit – das ist dabei unser täglicher Antrieb. Denn wir verbinden Krankenversorgung mit Forschung und Lehre, begrüßen den Fortschritt und entwickeln uns selbst immer weiter. So leisten wir einen wichtigen Beitrag für die Gesundheit und die Lebensqualität von über 500.000 Patientinnen und Patienten jährlich: kompetent, gewissenhaft und mit Leidenschaft.

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